A földfém-klaszter (BeMgCa...) dokumentációja

A gépek főleg kvantumkémiai számításokra szolgálnak. Mandrake CLIC Linux-on alapuló operációs rendszer alatt futnak. Az összeállítás lényege az egyszerű kezelhetőség, karbantarthatóság és bővíthetőség.

A klaszter jelenlegi tagjai:

Név Funkció Proc. Mem./GB Lemez/GB
be szerver Sempron 2800+ 2 160
he muszervezérlo Duron 600 256 13
mg Intel 4 150
node1 számoló Sempron 2800+ 3 140
node2 számoló Sempron 2700+ 2 140
node3 számoló Sempron 2700+ 2 150
node4 számoló Athlon MP 2000+ 2 150
node5 számoló Dual Athlon MP 2000+ 3 100
node7 számoló Sempron 2700+ 1 150
node8 számoló Athlon MP 2000+ 3 140
node6 számoló Sempron 2700+ 2 140
node9 számoló Athlon XP 2000+ 1 80
node10 számoló Athlon XP 2000+ 1 80
node11 számoló Athlon XP 2000+ 1 80
node12 számoló Athlon XP 1800+ 1 30
node13 számoló Athlon XP 1800+ 2 60
node14 számoló Athlon XP 1800+ 1 60
node15 számoló Dual Athlon MP 2000+ 4 50
node16 számoló Dual Athlon MP 2600+ 3 140
node17 számoló Dual Athlon MP 2600+ 4 50
node18 számoló Dual Athlon MP 2000+ 3 100
node19 számoló Dual Athlon MP 2000+ 2 100

2 percnél hosszabb futtatások csak a queue rendszeren keresztül mehetnek, ami automatikusan csak a számoló gépeket használja. Minden felhasználó rendelkezésére áll a /scr/$USER könyvtár, ahonnan használat után törölni kell mindent. A PQS és a Gaussian automatikusan használja ezt a tárolóhelyet.

Kvantumkémiai programok (a /progs könyvtárban, bash használóknak automatikus beállítás):

Queue rendszer: Torque (PBS) és Maui scheduler

Az alap parancsok más rendszerekből is ismertek: qstat, qsub, qdel. Ha gond van a tracejob és a checkjob parancsok segítenek a hiba kiderítésében.

Egyelőre két queue van, az érdekes az általános, neve verylong, hogy a ne kelljen változtatni a scripteken. Nincs rajta időkorlát. Jelenleg a jobok egyenletesen oszlanak el a gyakorlatilag egyforma gépek között. Ezen hangolhatunk, ha esetleg tele lesz a gép.

A Gaussian példa job-on kicsit frissítettem. Működik, érdemes használni a levélben küldött értesítést, akár külső címeket megadva, akár csak a usernevet. Jó lenne, ha minden felhasználó csinálna egy .forward file-t a könyvtárába, hogy a rendszerrel kapcsolatos leveleket megkapja (tartalma a működő email cím).